Een ontstekingsremmend eiwit dat vrijkomt wanneer bepaalde witte bloedcellen (neutrofiele granulocyten) sterven. Het bindt calcium en zink. Bovendien deactiveert het de microbiële enzymen waardoor de antibacteriële werking tegen schadelijke micro-organismen wordt onderdrukt. Bij chronische darmontstekingsziekten (IBD), zoals de ziekte van Crohn en colitis ulcerosa, hopen zich grote hoeveelheden witte bloedcellen op in de darmwand. De gemeten hoeveelheid calprotectine in de ontlasting komt overeen met het aantal ontstekingscellen in het maagdarmkanaal en kan dus gebruikt worden als maat voor de ernst van de ontsteking.