Schimmels
Mycobiota is een groep van alle schimmels die aanwezig zijn in een bepaald geografisch gebied (bijvoorbeeld 'de mycobiota van Ierland') of habitattype (zoals de darmmycobiota). Mycobiota bevindt zich aan het oppervlak en in het maagdarmstelsel van mensen. Er zijn maar liefst zesenzestig geslachten en 184 soorten in het maagdarmkanaal van gezonde mensen. De meeste hiervan zijn de Candida-soorten. Hoewel bij gezonde personen wordt vastgesteld dat ze op de huid en in het spijsverteringskanaal aanwezig zijn, kan de normale residente darm mycobiota pathogeen worden bij mensen met een verzwakte immuniteit. Dergelijke multispeciesinfecties leiden tot hogere sterfgevallen. Gisten zijn ook aanwezig op de huid, zoals Malassezia-soorten, waar ze olie consumeren die wordt afgescheiden door de talgklieren.